简介 :
宏病毒组(Virome ) 是在宏基因组学理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支 。 宏病毒组直接以样本 中所有病毒的遗传物质为研究对象,能够快速准确的鉴定 样本 中所有 的 病毒组成 ,不仅 在病毒发现、病毒溯源、微生物预警等研究方面具有重要作用 , 在病毒的起源和进化模式、遗传多样性和地理分布等研究方面也具有重要意义。宏病毒 组学应用广泛, 可应用于人或动物肠道或者血液样本、 水样 、土壤 样本 等的研究。
样品采集
AG亚游 生物 为客户提供样品采集的配套工具,如采集盒、取样勺和保存管等。
送样要求
样本量:
粪便: ≥ 1g ;
肠道内容物 ≥1 g
组织样本 ≥2 g
血液样本 ≥5 m L(血液样本建议送血清)
土壤,沉积物等 ≥5 g
清澈水体或海水: 2 0L 以上超滤浓缩或者 Fe C l 3 沉淀后送样;
样品保存期间切忌反复冻融,送样时请使用干冰运输 。
DNA/RNA 等核酸样本
(1) 样品 需求量 : ≥1μg;
(2) 样本浓度:≥50ng/μL;
(3) 样品纯度: OD260/280 在1.8-2.0 之间,确保 DNA 完整无降解;
(4) 对于本类型样品,在检测完样品的质量 合格后 , 方可 进行后续 实验。
技术路线
数据分析路线
测序平台
Illumina检测平台;PE150测序策略
部分结果示例
不同粪便样本病毒物种组成分析
eggNOG 功能注释
不同粪便样本病毒多样性分析
P CA 分析
以上结果示例节选自参考文献
Intestinal Virome in Patients With Alcoholic Hepatitis
原文链接: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8159727/
Multi-omics analyses show disease, diet, and transcriptome interactions with the virome
原文链接: https://www.gastrojournal.org/article/S0016-5085(21)03234-0/fulltext