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宏病毒组

简介

宏病毒组(Virome 是在宏基因组学理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支 宏病毒组直接以样本 中所有病毒的遗传物质为研究对象,能够快速准确的鉴定 样本 中所有 病毒组成 ,不仅 在病毒发现、病毒溯源、微生物预警等研究方面具有重要作用 在病毒的起源和进化模式、遗传多样性和地理分布等研究方面也具有重要意义。宏病毒 组学应用广泛, 可应用于人或动物肠道或者血液样本、 水样 、土壤 样本 等的研究。

样品采集

AG亚游 生物 为客户提供样品采集的配套工具,如采集盒、取样勺和保存管等。

送样要求

样本量:

粪便: 1g

肠道内容物 ≥1 g

组织样本 ≥2 g

血液样本 ≥5 m L(血液样本建议送血清)

土壤,沉积物等 ≥5 g

清澈水体或海水: 2 0L 以上超滤浓缩或者 Fe C l 3 沉淀后送样;

样品保存期间切忌反复冻融,送样时请使用干冰运输

DNA/RNA 等核酸样本

(1) 样品 需求量 ≥1μg;

(2) 样本浓度:≥50ng/μL;

(3) 样品纯度: OD260/280 在1.8-2.0 之间,确保 DNA 完整无降解;

(4) 对于本类型样品,在检测完样品的质量 合格后 方可 进行后续 实验。

技术路线

数据分析路线


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测序平台

Illumina检测平台;PE150测序策略

部分结果示例


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不同粪便样本病毒物种组成分析


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eggNOG 功能注释

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不同粪便样本病毒多样性分析

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P CA 分析

以上结果示例节选自参考文献

Intestinal Virome in Patients With Alcoholic Hepatitis

原文链接: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8159727/

Multi-omics analyses show disease, diet, and transcriptome interactions with the virome

原文链接: https://www.gastrojournal.org/article/S0016-5085(21)03234-0/fulltext